严格的无菌条件是植物组织培养成功的关键因素。接种室应该保证洁净、无菌，因而求墙壁、地面及天花板光滑无缝，以免灰尘和微生物的累积。窗户宜采用双层玻璃密封，防止昆虫、灰尘和微生物的进入。大型组培室一般在接种室入口处安装风淋室，小型、微型组培室不用风淋室可设计预备室，在进入灭菌接种室之前，进行必要的清净。接种室应安装空气调节装置，通风换气主要依靠空调进行，或者安装空气净化器。为了降低室内菌量，中大型组培室都在接种室（和预备室）内配备臭氧机，每天杀菌消毒；若资金紧张，至少也需安装紫外线灯用于照射灭菌。
接种室要求配备单人或双人超净工作台，及接种用的酒精灯、各种医用镊子、剪刀、手术刀、接种针、过滤灭菌器、贮藏70%及95%酒精或酒精棉球的广口瓶、试管架、载物台及手推车（用于放置与运送培养瓶）等工具，以及上面提到的臭氧机、空气净化器等。超净工作台要求定期清洗过滤膜。